| 13-Sep-03 Bundesliga 2003/2004 - M.5 | | Dortmund | 2-1 | Werder | | Wagner |
| 28-Feb-04 Bundesliga 2003/2004 - M.22 | | Werder | 2-0 | Dortmund | | |
| 27-Nov-04 Bundesliga 2004/2005 - M.15 | | Werder | 2-0 | Dortmund | | Fröhlich |
| 08-May-05 Bundesliga 2004/2005 - M.32 | | Dortmund | 1-0 | Werder | | Fröhlich |
| 17-Sep-05 Bundesliga 2005/2006 - M.5 | | Werder | 3-2 | Dortmund | | Wack |
| 10-Nov-06 Bundesliga 2006/2007 - M.12 | | Werder | 1-3 | Dortmund | | Wack |
| 15-Apr-07 Bundesliga 2006/2007 - M.29 | | Dortmund | 0-2 | Werder | | Meyer |
| 14-Sep-07 Bundesliga 2007/2008 - M.5 | | Dortmund | 3-0 | Werder | | Sippel |
| 29-Jan-08 DFB-Pokal 2007/2008 - | Last sixteen | Dortmund | 2-1 | Werder | | Fandel |
| 01-Mar-08 Bundesliga 2007/2008 - M.22 | | Werder | 2-0 | Dortmund | | Merk |
| 18-Oct-08 Bundesliga 2008/2009 - M.8 | | Werder | 3-3 | Dortmund | | Kempter, M |
| 28-Jan-09 DFB-Pokal 2008/2009 - M.3 | | Dortmund | 1-2 | Werder | | Gräfe |
| 21-Mar-09 Bundesliga 2008/2009 - M.25 | | Dortmund | 1-0 | Werder | | Kircher |
| 08-Nov-09 Bundesliga 2009/2010 - M.12 | | Werder | 1-1 | Dortmund | | Gräfe |
| 03-Apr-10 Bundesliga 2009/2010 - M.29 | | Dortmund | 2-1 | Werder | | Rafati |
| 11-Dec-10 Bundesliga 2010/2011 - M.16 | | Dortmund | 2-0 | Werder | | Meyer |
| 07-May-11 Bundesliga 2010/2011 - M.33 | | Werder | 2-0 | Dortmund | | Perl |
| 14-Oct-11 Bundesliga 2011/2012 - M.9 | | Werder | 0-2 | Dortmund | | Meyer |
| 17-Mar-12 Bundesliga 2011/2012 - M.26 | | Dortmund | 1-0 | Werder | | Aytekin |
| 24-Aug-12 Bundesliga 2012/2013 - M.1 | | Dortmund | 2-1 | Werder | | Zwayer |
| 19-Jan-13 Bundesliga 2012/2013 - M.18 | | Werder | 0-5 | Dortmund | | Kircher |
| 23-Aug-13 Bundesliga 2013/2014 - M.3 | | Dortmund | 1-0 | Werder | | Zwayer |
| 08-Feb-14 Bundesliga 2013/2014 - M.20 | | Werder | 1-5 | Dortmund | | Perl |
| 20-Dec-14 Bundesliga 2014/2015 - M.17 | | Werder | 2-1 | Dortmund | | Gräfe |
| 23-May-15 Bundesliga 2014/2015 - M.34 | | Dortmund | 3-2 | Werder | | Gräfe |
| 31-Oct-15 Bundesliga 2015/2016 - M.11 | | Werder | 1-3 | Dortmund | | Welz |
| 02-Apr-16 Bundesliga 2015/2016 - M.28 | | Dortmund | 3-2 | Werder | | Welz |
| 21-Jan-17 Bundesliga 2016/2017 - M.17 | | Werder | 1-2 | Dortmund | | Siebert |
| 20-May-17 Bundesliga 2016/2017 - M.34 | | Dortmund | 4-3 | Werder | | Perl |
| 09-Dec-17 Bundesliga 2017/2018 - M.15 | | Dortmund | 1-2 | Werder | | Gräfe |
| 29-Apr-18 Bundesliga 2017/2018 - M.32 | | Werder | 1-1 | Dortmund | | Brych |
| 15-Dec-18 Bundesliga 2018/2019 - M.15 | | Dortmund | 2-1 | Werder | | Winkmann |
| 05-Feb-19 DFB-Pokal 2018/2019 - M.3 | Round of 16 | Dortmund | 3-3
(2-4) | Werder | | Brych |
| 04-May-19 Bundesliga 2018/2019 - M.32 | | Werder | 2-2 | Dortmund | | Fritz |
| 28-Sep-19 Bundesliga 2019/2020 - M.6 | | Dortmund | 2-2 | Werder | | Aytekin |
| 04-Feb-20 DFB-Pokal 2019/2020 - M.3 | Round of 16 | Werder | 3-2 | Dortmund | | Winkmann |
| 22-Feb-20 Bundesliga 2019/2020 - M.23 | | Werder | 0-2 | Dortmund | | Fritz |
| 15-Dec-20 Bundesliga 2020/2021 - M.12 | | Werder | 1-2 | Dortmund | | Schröder |
| 18-Apr-21 Bundesliga 2020/2021 - M.29 | | Dortmund | 4-1 | Werder | | Dankert |
| 20-Aug-22 Bundesliga 2022/2023 - M.3 | | Dortmund | 2-3 | Werder | | Badstübner |
| 11-Feb-23 Bundesliga 2022/2023 - M.20 | | Werder | 0-2 | Dortmund | | Brych |
| 20-Oct-23 Bundesliga 2023/2024 - M.8 | | Dortmund | 1-0 | Werder | | Brych |
| 09-Mar-24 Bundesliga 2023/2024 - M.25 | | Werder | 1-2 | Dortmund | | Aytekin |
| 31-Aug-24 Bundesliga 2024/2025 - M.2 | | Werder | 0-0 | Dortmund | | Hartmann |
| 25-Jan-25 Bundesliga 2024/2025 - M.19 | | Dortmund | 2-2 | Werder | | Dingert |
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